集群矩阵模式是指首先建立主账号，然后再建立若干相关联账号的矩阵模式，构成集群矩阵体系。例如，企业可以先建立一个企业账号，然后再建立各主要产品（或品牌）的账号，这样可以强化各产品的特点，加强对关注产品的粉丝的影响与互动。

地方政府较多地采用集群矩阵模式，首先建立地方政府主账号，然后建立旅游、美食、交通、平安、政务等账号，形成信息发布、特色推荐、政务服务、民众互动等矩阵运营体系。